В период с 1964 по 1971 г. на базе БМРТ типа "Маяковский" было построено шесть судов проекта 399. Они были первыми отечественными научно-исследовательскими судами, построенными в промысловом варианте по специальному проекту. Назначение судов этого типа было проведение комплексных рыбохозяйственных исследований в области поиска рыбы, гидроакустики, океанологии,  гидрологии, гидробиологии, ихтиологии и технологии обработки уловов. Для этих целей имелись 12 лабораторий общей площадью 110 м2 для проведения научных работ, станция легководолазов с рекомпрессионной камерой, подводная обитаемая наблюдательная камера, а также 4 океанографических лебедки.
  Кроме того было построено еще два судна согласно проекту 399Б. Они были оборудованы глубоководными обитаемыми аппаратами типа "Север-2".